Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL9P32969 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL9P32969 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPL9P32969 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL9P32969 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL9P32969 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL9P32969 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL9P32969 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL9P32969 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL9P32969 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL9P32969 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL9P32969 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL9P32969 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL9P32969 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL9P32969 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL9P32969 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL9P32969 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms