Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP1P32455 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP1P32455 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP1P32455 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP1P32455 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP1P32455 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP1P32455 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP1P32455 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP1P32455 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP1P32455 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms