Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA11P31270 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms