Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRABP1P29762 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms