Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOS1P29475 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOS1P29475 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOS1P29475 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOS1P29475 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOS1P29475 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOS1P29475 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOS1P29475 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOS1P29475 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOS1P29475 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOS1P29475 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOS1P29475 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOS1P29475 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOS1P29475 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NOS1P29475 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NOS1P29475 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NOS1P29475 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NOS1P29475 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NOS1P29475 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NOS1P29475 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NOS1P29475 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NOS1P29475 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOS1P29475 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOS1P29475 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOS1P29475 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOS1P29475 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NOS1P29475 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NOS1P29475 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NOS1P29475 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms