Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB2P29323 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms