Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJB2P29033 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB2P29033 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB2P29033 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB2P29033 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB2P29033 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB2P29033 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB2P29033 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJB2P29033 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJB2P29033 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB2P29033 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB2P29033 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB2P29033 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB2P29033 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms