Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR2CP28335 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2CP28335 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms