Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELK4P28324 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELK4P28324 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELK4P28324 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELK4P28324 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK4P28324 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK4P28324 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK4P28324 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK4P28324 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms