Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1BP28222 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1BP28222 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms