Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IVDP26440 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IVDP26440 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IVDP26440 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IVDP26440 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IVDP26440 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IVDP26440 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IVDP26440 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IVDP26440 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IVDP26440 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IVDP26440 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IVDP26440 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IVDP26440 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IVDP26440 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IVDP26440 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms