Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIAP25963 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIAP25963 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms