Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA3P25788 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms