Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YY1P25490 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YY1P25490 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YY1P25490 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YY1P25490 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YY1P25490 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YY1P25490 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
YY1P25490 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YY1P25490 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
YY1P25490 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YY1P25490 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
YY1P25490 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YY1P25490 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YY1P25490 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YY1P25490 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YY1P25490 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YY1P25490 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YY1P25490 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YY1P25490 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YY1P25490 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
YY1P25490 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YY1P25490 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YY1P25490 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms