Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTAFRP25105 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms