Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFL1P23528 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFL1P23528 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFL1P23528 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFL1P23528 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFL1P23528 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms