Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB1P20618 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB1P20618 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms