Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD53P19397 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD53P19397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD53P19397 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD53P19397 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD53P19397 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD53P19397 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD53P19397 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD53P19397 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD53P19397 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD53P19397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD53P19397 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD53P19397 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms