Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR1P18146 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR1P18146 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR1P18146 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EGR1P18146 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR1P18146 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR1P18146 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms