Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF4P18085 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF4P18085 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARF4P18085 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARF4P18085 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARF4P18085 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARF4P18085 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARF4P18085 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARF4P18085 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARF4P18085 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARF4P18085 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms