Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEBPBP17676 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPBP17676 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPBP17676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms