Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA2P17301 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms