Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD44P16070 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD44P16070 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD44P16070 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD44P16070 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD44P16070 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD44P16070 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD44P16070 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD44P16070 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD44P16070 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD44P16070 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD44P16070 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD44P16070 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD44P16070 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD44P16070 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms