Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF4P15884 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF4P15884 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF4P15884 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF4P15884 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF4P15884 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF4P15884 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF4P15884 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF4P15884 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF4P15884 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF4P15884 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF4P15884 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF4P15884 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF4P15884 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF4P15884 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF4P15884 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms