Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME1P15531 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME1P15531 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME1P15531 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME1P15531 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME1P15531 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME1P15531 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME1P15531 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME1P15531 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME1P15531 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME1P15531 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME1P15531 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME1P15531 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME1P15531 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME1P15531 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME1P15531 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME1P15531 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME1P15531 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME1P15531 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME1P15531 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME1P15531 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME1P15531 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME1P15531 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME1P15531 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NME1P15531 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME1P15531 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME1P15531 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms