Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCSHP14314 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.5 ms