Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRF1P14222 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRF1P14222 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRF1P14222 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRF1P14222 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRF1P14222 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRF1P14222 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRF1P14222 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRF1P14222 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms