Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCP1P13796 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCP1P13796 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCP1P13796 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCP1P13796 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP1P13796 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP1P13796 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP1P13796 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP1P13796 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP1P13796 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP1P13796 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP1P13796 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP1P13796 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP1P13796 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms