Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD8P13378 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD8P13378 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms