Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN1P12814 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms