Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARSP12081 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HARSP12081 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HARSP12081 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HARSP12081 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARSP12081 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARSP12081 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARSP12081 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARSP12081 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARSP12081 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARSP12081 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARSP12081 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARSP12081 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARSP12081 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARSP12081 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARSP12081 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARSP12081 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARSP12081 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARSP12081 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARSP12081 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARSP12081 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms