Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2P10911 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2P10911 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCF2P10911 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCF2P10911 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCF2P10911 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCF2P10911 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2P10911 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2P10911 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2P10911 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2P10911 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCF2P10911 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2P10911 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2P10911 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2P10911 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCF2P10911 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCF2P10911 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCF2P10911 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCF2P10911 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2P10911 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2P10911 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2P10911 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2P10911 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms