Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TGFB3P10600 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFB3P10600 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms