Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR2F1P10589 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms