Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRFP10586 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms