Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYNX1P0DP58 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYNX1P0DP58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms