Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms