Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms