Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms