Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms