Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P0C879 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P0C879 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P0C879 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P0C879 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P0C879 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P0C879 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P0C879 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P0C879 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P0C879 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P0C879 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P0C879 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P0C879 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P0C879 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P0C879 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P0C879 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P0C879 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms