Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4AP0C0L4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4AP0C0L4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms