Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP1P09874 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP1P09874 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP1P09874 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARP1P09874 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP1P09874 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP1P09874 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP1P09874 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP1P09874 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP1P09874 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP1P09874 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP1P09874 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP1P09874 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP1P09874 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP1P09874 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP1P09874 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP1P09874 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP1P09874 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP1P09874 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP1P09874 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP1P09874 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP1P09874 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP1P09874 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP1P09874 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP1P09874 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms