Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRBP09619 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRBP09619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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