Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FHP07954 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FHP07954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FHP07954 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FHP07954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FHP07954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FHP07954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FHP07954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FHP07954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FHP07954 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHP07954 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHP07954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHP07954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FHP07954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHP07954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHP07954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FHP07954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FHP07954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FHP07954 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms