Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPBP07199 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPBP07199 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPBP07199 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPBP07199 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CENPBP07199 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CENPBP07199 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CENPBP07199 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPBP07199 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CENPBP07199 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CENPBP07199 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CENPBP07199 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CENPBP07199 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPBP07199 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPBP07199 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPBP07199 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPBP07199 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPBP07199 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPBP07199 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPBP07199 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPBP07199 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPBP07199 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPBP07199 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPBP07199 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CENPBP07199 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CENPBP07199 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CENPBP07199 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPBP07199 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPBP07199 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPBP07199 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPBP07199 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms