Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA4P06727 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA4P06727 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA4P06727 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA4P06727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA4P06727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA4P06727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA4P06727 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA4P06727 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA4P06727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms