Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND3P03897 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND3P03897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms