Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL2A1P02458 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms