Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-17P01599 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-17P01599 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms